فاضلاب مرکز از بدو تأسیس تا کنون بصورت سیستم فاضلاب قدیمی از نوع چاه بوده است که با هماهنگی های انجام شده با اداره آب و فاضلاب شهرستان آبادان و کسب مجوز های لازم، فاضلاب مرکز به فاضلاب شهری وصل شد.